news 2026/6/9 1:35:58

卡梅德生物技术快报|噬菌体筛选:技术实操:宽谱大肠杆菌噬菌体筛选全流程与性能验证方案

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张小明

前端开发工程师

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卡梅德生物技术快报|噬菌体筛选:技术实操:宽谱大肠杆菌噬菌体筛选全流程与性能验证方案

在微生物抗菌技术研发领域,针对耐药性致病菌的噬菌体研发是当下热门方向。畜禽源大肠杆菌耐药性逐年加剧,常规抗菌方案失效,促使行业加大对裂解性噬菌体的研发投入。而宿主谱狭窄是天然噬菌体的共性技术痛点,这就要求研发人员建立标准化、可复现的噬菌体筛选流程,定向筛选宽谱活性噬菌体。本文结合完整实验案例,详解从样本采集、菌株分离、噬菌体筛选到性能验证的全流程技术要点,同时展示试验数据与技术结论,为同类微生物研发项目提供实操参考。本次试验目标为:从养殖污水中完成噬菌体筛选,获得可裂解猪、鸡、牛多源大肠杆菌的宽谱噬菌体,并完成体外杀菌效果量化评估。

试验前期核心工作为样本采集与致病菌分离鉴定,这是噬菌体筛选的基础前提。试验样本采集自辽宁、北京、新疆三地规模化养殖场,包含患病畜禽病灶样本与养殖污水样本,所有样本低温冷藏转运至实验室,避免微生物失活。细菌分离采用选择性培养基分离法,分别使用麦康凯培养基、伊红 - 美蓝培养基划线接种,37 ℃恒温培养 24 h 后挑取典型菌落。大肠杆菌在两种培养基上会形成特征性菌落,结合革兰氏染色镜检(菌体为红色杆状)完成初步判定。初筛菌株进一步接入 LB 液体培养基振荡培养,制备对数生长期菌液。分子鉴定环节采用 16S rRNA PCR 技术:取菌落制备 DNA 模板,使用通用引物进行扩增,扩增产物电泳后条带约 1500 bp,与目标片段一致。扩增产物测序后上传至 NCBI 数据库比对,最终确认 18 株目标大肠杆菌,菌株分类:猪源 2 株、牛源 2 株、鸡源 14 株。标准化的菌株分离与鉴定流程,保证了宿主菌的纯度,从源头规避噬菌体筛选过程中的杂菌干扰。

菌株库搭建完成后,进入核心环节 ——噬菌体筛选、分离与纯化。试验选用养殖污水作为噬菌体分离基质,具体操作参数如下:污水样本 8000 r/min 离心,取 1 mL 上清液,混合 20 μL 对数期宿主菌液、1 mL LB 液体培养基,设置培养条件为 37 ℃、140 r/min,连续培养 12 h。培养结束后再次 8000 r/min 离心 10 min,取上清液经 0.22 μm 无菌滤膜过滤,去除活菌与杂质,得到粗制噬菌体液。噬菌体纯化采用行业通用的双层平板法:底层为凝固的 LB 固体培养基,上层为混合了宿主菌的 LB 半固体培养基,滴加 10 μL 粗制噬菌体液,37 ℃孵育 4 h 后观察噬菌斑。为保证噬菌体为单一毒株,连续纯化 3 次,最终获得噬菌斑形态统一的烈性噬菌体 vB_Eco_E10。在噬菌体筛选实操中,离心转速、滤膜孔径、培养温度等参数直接影响分离成功率,0.22 μm 滤膜可完全截留细菌,仅允许噬菌体通过,是该环节的关键质控点。

完成噬菌体纯化后,依次开展宿主谱测定与体外杀菌试验,量化评估噬菌体的核心性能。第一部分宿主谱测定:针对 18 株大肠杆菌逐一进行裂解试验,操作方式与纯化阶段一致,通过噬菌斑有无判定裂解活性。试验结果统计:vB_Eco_E10 对 9 株菌株具备裂解能力,整体裂解率 50%;其中猪源菌株裂解 1 株、牛源菌株裂解 1 株、鸡源菌株裂解 7 株,实现跨物种裂解,达到宽谱噬菌体的筛选目标。第二部分为 12 h 动态体外杀菌试验,试验载体选用 24 孔细胞培养板,体系配置:3 mL LB 液体培养基 + 100 μL 菌液(浓度 1×10⁵ CFU/mL)+100 μL 噬菌体液(浓度 1×10⁸ PFU/mL)。试验分组设置:噬菌体 + 菌株组、纯菌株对照组、空白 PBS 对照组,每组设置 3 个生物学重复。每间隔 1 小时设置一组试验孔,培养 12 h 后统一使用酶标仪检测 OD600 数值,以此表征细菌生物量。

试验最终量化数据如下:所有受试菌株在培养 4~5 h 进入对数生长期,7 h 后生长放缓。对比对照组与试验组 OD600 数值,培养 12 h 后,噬菌体对猪源菌株 LNE10 的抑菌率为 36.8%;对鸡源菌株 LNB27、牛源菌株 LNL14 的抑菌率均为 15.8%。数据反映出该噬菌体对不同来源大肠杆菌的裂解能力存在差异,猪源菌株抑制效果最优,鸡源、牛源菌株效果次之,该现象与不同菌株表面噬菌体受体的表达量相关。从技术层面分析,本次通过噬菌体筛选得到的 vB_Eco_E10,其跨物种裂解特性,证明该噬菌体识别的受体在畜禽源大肠杆菌中具有保守性,这也是宽谱噬菌体的典型特征。

总结整套试验流程与技术要点:样本溯源选择本土养殖污水,能提升噬菌体筛选的适配度;双层平板法结合多次纯化,可保障噬菌体单一性;多源菌株库能全面验证噬菌体宿主谱。本次试验得到的 vB_Eco_E10 各项性能指标稳定,可纳入噬菌体资源库,作为复合噬菌体制剂的核心原料。对于微生物研发团队而言,本套标准化流程可直接应用于其他致病菌的噬菌体筛选工作。后续技术优化方向可聚焦于:扩大菌株验证范围、优化培养条件提升噬菌体活性、开展多噬菌体复配试验,进一步提升杀菌谱与抑菌效率,推动该技术从实验室走向产业化应用。

参考文献:宋蕊,刘衍芬,贺永明,等.1 株宽谱型大肠杆菌噬菌体筛选及杀菌效果评估 [J]. 辽宁农业职业技术学院学报,2026,28 (3):1-4.

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